Все обители ордена объединены в конгрегацию, управляемую генеральным капитулом, хотя отдельные монастыри пользуются самой широкой автономией; капитул назначает ответственных за ежегодную инспекцию всех монастырей.
Конституция ордена носит название — Хартия милосердия (Carta caritatis), её составителем по традиции считается третий аббат Цистерцианского монастыря святой Стефан Хардинг (умер в 1134).
Существуют женские цистерцианские монастыри, первый из них по времени был основан в 1120. Самый известный — Пор-Рояль.
Облачение цистерцианцев — белое одеяние с чёрным наплечником, чёрный капюшоном и чёрным шерстяным поясом.
В 2005 году цистерцианцы насчитывали 1 470 монахов, из которых 717 были священниками. Ордену принадлежало 87 обителей.